自動(dòng)生化分析儀有多種分類方法，常用的是按其反應(yīng)裝置的結(jié)構(gòu)進(jìn)行分類。按此法可將自動(dòng)生化分析儀分為流動(dòng)式和分立式兩大類。
流動(dòng)式自動(dòng)生化分析儀是指測(cè)定項(xiàng)目相同的各待測(cè)樣品與試劑混合后的化學(xué)反應(yīng)在同一管道流動(dòng)的過程中完成。這是一代自動(dòng)生化分析儀。過去說得多少通道的生化分析儀指的就是這一類。存在較嚴(yán)重的交叉污染，結(jié)果不太準(zhǔn)確，現(xiàn)已淘汰。
分立式自動(dòng)生化分析儀與流動(dòng)式的主要差別是每個(gè)待測(cè)樣品與試劑混合間的化學(xué)反應(yīng)都是分別在各自的反應(yīng)皿中完成的，不易出現(xiàn)交叉污染，結(jié)果可靠。
流動(dòng)式自動(dòng)生化分析儀
空氣分段系統(tǒng)
這種分析儀的特點(diǎn)是通過比例定量泵擠壓彈性樣品管、空氣管和試劑管(通稱“泵管”)，將樣品依次連續(xù)地吸入并沿樣品管輸送，另一方面由空氣管吸入的氣泡將由同樣原理吸入并在試劑管道中連續(xù)流動(dòng)的試劑分成均勻的節(jié)段，樣品流和試劑流在連續(xù)向前流動(dòng)的過程中相遇、混合、透吸(必要時(shí))、保溫、反應(yīng)及被測(cè)定。整個(gè)分析過程是液流在管道中連續(xù)流動(dòng)的過程中完成的。
非分段系統(tǒng)
非分段系統(tǒng)是靠試劑空白或緩沖液來間隔每個(gè)樣品的反應(yīng)液，這樣，在管道中連續(xù)流動(dòng)的液體不被分段。非分段系統(tǒng)可再分為流動(dòng)注入系統(tǒng)和間隙系統(tǒng)。
1、流動(dòng)注入系統(tǒng)：該系統(tǒng)的組成與空氣分段系統(tǒng)相似，但某些結(jié)構(gòu)和工作原理有所不同，空氣分段系統(tǒng)是利用氣泡分段來防止管道中各反應(yīng)液在流動(dòng)過程中的交叉污染，而流動(dòng)注入系統(tǒng)則是通過將樣品依次注入連續(xù)流動(dòng)的試劑流管道中來達(dá)到防止交叉污染的目的的。
2、間隙系統(tǒng)：該系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)、組成和工作原理與流動(dòng)注入系統(tǒng)相似，但其特點(diǎn)是每一次進(jìn)樣都必須在前一樣品的分析過程結(jié)束后(包括管道的清洗)才能開始，而不能連續(xù)地依次進(jìn)樣，每次進(jìn)樣間有一時(shí)間間隙，故有人稱為不連續(xù)流動(dòng)式分析儀。
分立式自動(dòng)生化分析儀
分立式為第二代自動(dòng)生化分析儀，它與流動(dòng)式的主要差別是每個(gè)待測(cè)樣品與試劑混合間的化學(xué)反應(yīng)都是分別在各自的反應(yīng)皿中完成的。
稱為第三代自動(dòng)生化分析儀的離心式自動(dòng)生化分析儀，也應(yīng)屬于分立式。因?yàn)樵陔x心式分析儀中，每個(gè)待測(cè)樣品都是在離心力作用下，在各自的反應(yīng)槽內(nèi)與試劑混合，并完成化學(xué)反應(yīng)，繼而被測(cè)定的。離心式分析儀屬于“同步分析”，在離心力的作用下，各待測(cè)樣品幾乎同時(shí)與試劑混合、反應(yīng)并被測(cè)定后打出報(bào)告；而其它分析儀是“順序分析”，即各待測(cè)樣品依次與試劑混合、反應(yīng)先后被測(cè)定。
袋式自動(dòng)生化分析儀也應(yīng)屬于分立式，它是用試劑袋代替反應(yīng)管和比色皿，測(cè)定時(shí)每個(gè)待測(cè)樣品在各自的試劑袋內(nèi)進(jìn)行反應(yīng)并被檢測(cè)。還有一種稱為“干式自動(dòng)生化分析儀”也屬于分立式。它的主要特點(diǎn)是采用固相化學(xué)技術(shù)，即將試劑固相于膠片或?yàn)V紙小片等載體上。測(cè)定時(shí)使一定量的待測(cè)樣品分布于一張?jiān)嚰埰?，一定時(shí)間后用反射光度計(jì)測(cè)定。
